یکی از ضروری ترین کار ها بعد از ورود پرنده جدید قرنطینه شدن است.وقتی که می خواهید پرنده یا پرندگان جدیدی وارد یک مجموعه که از قبل داشته اید بکنید ابتدا باید برای حفظ پرنده های قدیمی تازه واردین قرنطینه شوند.پرندگان جدید در محیط منحصر به فرد خود تا قبل از این که به دست شما برسند,زندگی می کردند و نسبت به میکروب های ان محل مصونیت دارند آنها روزانه در معرض مریضی های گوناگونی قرار داشته اند به همین سبب قرنطینه یک امر ضروری تلقی می شود صرف نظر از این که پرنده جدید از فروشگاه یا پرورشگاه معتبری خریداری شده باشد. پرنده جدید ممکن است از کشور دیگری وارد شده باشد که در این صورت در اکو سیستم ودر یک محیط کاملا جدید در معرض انوع میکروب است.که در طی این انتقال به محل جدید استرس های فراوانی را تجربه خواهد کرد.این استرس ها می تواند بسیار جزئی و یا خیلی ناراحتی عمده ای برای پرنده ایجاد کند که این شرایط بسته به محیط زندگی پرنده متفاوت است و امکان دارد واکنش های مختلفی را از خو بروز دهند.در طول این مدت که به پرنده استرس وارد می شود ممکن است سیستم ایمنی بدن پرنده تضعیف شود،و احتمال اینکه این عارضه را به شکل فیزیکی نمایان شود بسیار زیاد است و اگر پرنده در قرنطینه نباشد در معرض میلیون هامیکروب قرار گیرد و سیستم ایمنی بدن پرنده در پاسخ به این میکروب های جدید به طور حتم دوام نمی اورد در واقع سیستم ایمنی به طور معمول نمی تواند پاتوژن برای از بین بردن میکروب ها بسازد. پرندهای جدید که وارد محل تازه می شوند امکان گرفتن میکروب از محل جدید را دارند و این امکان نیز هست که انها از محل قبلی زندگی خود میلیون ها میکروب وارد محل جدید کنند.همانطور که گفته شد ممکن است پرندگان جدید سالم بوده باشند اما با ورود به محل جدید در معرض میکروب جدیدی قرار گیرند که تا به حال پاتوژن ان میکروب در بدنشان ساخته نشده باشدو باعث می شود مصونیت انها در برابر میکروب های جدید کم باشد و از بین بروند البته در این زمان گمان میشود که پرنده جدید مریضی از قبل داشته ولی این فرضیه اشتباه است. پس با این تفاسیر بهتر است که پرندگان جدید ابتدا مدتی در قرنطینه باشند تا استرس انها به حداقل رسیده و به مکان جدید عادت کرده و بیماری های احتمالی شان شناخته شود ودر صورت امکان معالجه شوند و سپس بعد از اتمام این مراحل پرنده های جدید را به تدریج به محل پرندگان قدیمی اضافی کرد که اگر در معرض میکروب های جدید قرار گرفتند به تدرج مصونیت در برابر میکروبهای جدید در انها هم ایجاد شود.